Kahramanımız geri döndü ve şimdi 15 yaşında. Büyükbaba Max’in kaybolması üzerine Ben Omnitrix’i yeniden takar ve tuhaf birşeyler olduğunu farkeder.

Beş yıllık bir aradan sonra, Omnitrix kendini yenilemiştir ve Ben yeni uzaylıların ona getirdiği güçleri geliştirmeli, Yüksek Irk (HighBreeds), DNAliens ve Sonsuz Şövalyeler (Forever Knights) gibi yeni kötülerin güçlerine karşı kendi güçlerini en iyi şekilde kullanmayı öğrenmelidir.